Pierre Lory est directeur d'études à l'Ecole Pratique des Hautes Etudes, en Sciences Religieuses, détenteur de la chaire de Mystique musulmane. Il est également membre des comités de rédaction de la Revue de l'Histoire des Religions, du Journal of the History of Sufism, du Bulletin critique des annales islamologiques. Il est secrétaire de l'Association des amis de Henry et Stella Corbin. Son travail scientifique porte principalement sur le thème de la mystique et  de l’ésotérisme en Islam. Il a signé plusieurs articles dans la deuxième et la troisième édition de Encyclopédie de l'Islam (Leyde, Brill). Plusieurs de ses livres sont traduits en arabe, en turc, en persan, en espagnol.